Protein knowledgebaseSequence archiveHelp pages, FAQs, UniProtKB manual, documents, news archive and Biocuration projects.Sequence clustersProtein sets from fully sequenced genomesAnnotation systemsSystems used to automatically annotate proteins with high accuracy:Supporting dataSelect one of the options below to target your search:EF-hand protein 5N/ALeishmania tarentolae (Sauroleishmania tarentolae)-Annotation score: Annotation score: 1 out of 5-Protein inferred from homologyiFunctioniRegionsFeature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActionsCalcium bindingi121Calcium bindingi122GO - Molecular functioniKeywords - Ligandi, Names & TaxonomyiProtein namesiRecommended name:EF-hand protein 5Short name: EFH5OrganismiTaxonomic identifieri
[]Taxonomic lineagei &
PTM / ProcessingiMolecule processingFeature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActionsChaini186EF-hand protein 5PRO_Structurei3D structure databases
ProteinModelPortali
MobiDBiFamily & DomainsiDomains and RepeatsFeature keyPosition(s)LengthDescriptionGraphical viewFeature identifierActionsDomaini36EF-hand 1Domaini36EF-hand 2Domaini36EF-hand 3Domaini38EF-hand 4Sequence similaritiesiContains 4 s.Keywords - DomainiFamily and domain databases
Gene3Di 1 hit.
InterProi EF-hand-dom_pair.
EF_hand_dom.
SUPFAMi SSF47473. 1 hit.
PROSITEi EF_HAND_2. 1 hit.
[]SequenceiSequence statusi: Complete.P41045-1 []
50MSRSKEVSPN LSQQKRGDVR SAGISGFSSP IYRGRLNHSA SAELQEGYRI
100LTGGQKANII SDKDLFKAIH SCGLHTSEEE VNDLLRVVHQ DERTLGLEFP
150EFMMLMTKGI DEASIAEMRR PFSVLDKAKT GVITKKQFTE LFVSSGEHSS
180 AEELEELMLL AETSEELEVV DYNKLINELA ILLNKM
18620,805February 1, 1995 - v1Checksum:i60BA2F4A93A9580EBLASTProtParamProtScaleCompute pI/MWPeptideMassPeptideCutterSequence databases
Select the link destinations:EMBLiGenBankiDDBJi Genomic DNA. Translation: .
PIRi Cross-referencesiSequence databases
Select the link destinations:EMBLiGenBankiDDBJi Genomic DNA. Translation: .
PIRi 3D structure databases
ProteinModelPortali
MobiDBiProtocols and materials databases
Structural Biology KnowledgebaseFamily and domain databases
Gene3Di 1 hit.
InterProi EF-hand-dom_pair.
EF_hand_dom.
SUPFAMi SSF47473. 1 hit.
PROSITEi EF_HAND_2. 1 hit.
ProtoNetiPublicationsi"A homologue of the T. brucel EFH5 gene in leishmania tarentolae.", , , Submitted (OCT-1992) to the EMBL/GenBank/DDBJ databasesCited for: NUCLEOTIDE SEQUENCE [GENOMIC DNA]. Strain: . Submitted (SEP-1994) to the EMBL/GenBank/DDBJ databasesCited for: SEQUENCE REVISION. MiscellaneousiMiscellaneousThis protein has four EF-hand homolog domains, two of which may be functional calcium-binding sites.Documents
Index of protein domains and families
Similar proteinsiLinks to similar proteins from the UniProt Reference Clusters (UniRef) at 100%, 90% and 50% sequence identity:UniRef100 combines identical sequences and sub-fragments with 11 or more residues from any organism into one UniRef entry.UniRef90 is built by clustering UniRef100 sequences that have at least 90% sequence identity to, and 80% overlap with, the longest sequence (a.k.a seed sequence).UniRef50 is built by clustering UniRef90 seed sequences that have at least 50% sequence identity to, and 80% overlap with, the longest sequence in the cluster.最近参与的小组帖子
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GDB 多线程调试 - 技术文档 - 程序开发 Linux时代 - 开源、自由
GDB 多线程调试 来源: ChinaUnix博客 　日期： 21:10　(共有条评论) 一直对GDB多线程调试接触不多，最近因为工作有了一些接触，简单作点记录吧。 先介绍一下GDB多线程调试的基本命令。 info threads 显示当前可调试的所有线程，每个线程会有一个GDB为其分配的ID，后面操作线程的时候会用到这个ID。 前面有*的是当前调试的线程。 thread ID 切换当前调试的线程为指定ID的线程。 break thread_test.c:123 thread all在所有线程中相应的行上设置断点thread apply ID1 ID2 command 让一个或者多个线程执行GDB命令command。 thread apply all command 让所有被调试线程执行GDB命令command。 set scheduler-locking offonstep 估计是实际使用过多线程调试的人都可以发现，在使用step或者continue命令调试当前被调试线程的时候，其他线程也是同时执行的，怎么只让被调试程序执行呢？通过这个命令就可以实现这个需求。off 不锁定任何线程，也就是所有线程都执行，这是默认值。 on 只有当前被调试程序会执行。 step 在单步的时候，除了next过一个函数的情况(熟悉情况的人可能知道，这其实是一个设置断点然后continue的行为)以外，只有当前线程会执行。 在介绍完基本的多线程调试命令后，大概介绍一下GDB多线程调试的实现思路。 比较主要的代码是thread.c，前面介绍的几个命令等都是在其中实现。 thread_list这个表存储了当前可调试的所有线程的信息。 函数add_thread_silent或者add_thread(不同版本GDB不同)用来向thread_list列表增加一个线程的信息。 函数delete_thread用来向thread_list列表删除一个线程的信息。 上面提到的这2个函数会被有线程支持的target调用，用来增加和删除线程，不同的OS对线程的实现差异很大，这么实现比较好的保证了GDB多线程调试支持的扩展性。 函数info_threads_command是被命令info threads调用的，就是显示thread_list列表的信息。 函数thread_command是被命令thread调用，切换当前线程最终调用的函数是switch_to_thread，这个函数会先将当前调试线程变量inferior_ptid，然后对寄存器和frame缓冲进行刷新。 函数thread_apply_command被命令thread apply调用，这个函数的实际实现其实很简单，就是先切换当前线为指定线程，然后调用函数execute_command调用指定函数。 比较特别的是set scheduler-locking没有实现在thread.c中，而是实现在控制被调试程序执行的文件infrun.c中。 对其的设置会保存到变量scheduler_mode中，而实际使用这个变量的函数只有用来令被调试程序执行的函数resume。在默认情况下， 传递给target_resume的变量是resume_ptid，默认情况下其的值为RESUME_ALL，也就是告诉target程序执行的时候所有 被调试线程都要被执行。而当scheduler_mode设置为只让当前线程执行的时候，resume_ptid将被设置为inferior_ptid， 这就告诉target只有inferior_ptid的线程会被执行。 最后特别介绍一下Linux下多线程的支持，基本的调试功能在linux-nat.c中，这里有对Linux轻量级别进程本地调试的支持。但是其 在调试多线程程序的时候，还需要对pthread调试的支持，这个功能实现在linux-thread-db.c中。对pthread的调试要通过调用 libthread_db库来支持。 这里有一个单独的target&multi-thread&，这个target有2点很特别: 第一，一般target的装载是在调用相关to_open函数的时候调用push_target进行装载。而这个target则不同，在其初始化 的时候，就注册了函数thread_db_new_objfile到库文件attach事件中。这样当GDB为调试程序的动态加载库时候attach库文 件的时候，就会调用这个函数thread_db_new_objfile。这样当GDB装载libpthread库的时候，最终会装载 target&multi-thread&。 第二，这个target并没有像大部分target那样自己实现了全部调试功能，其配合linux-nat.c的代码的功能，这里有一个target多层结构的设计，要介绍的比较多，就不详细介绍了。 最后介绍一下我最近遇见的一个多线程调试和解决。 基本问题是在一个Linux环境中，调试多线程程序不正常，info threads看不到多线程的信息。 我先用命令maintenance print target-stack看了一下target的装载情况，发现target&multi-thread&没有被装载，用GDB对GDB进行调试，发现在 函数check_for_thread_db在调用libthread_db中的函数td_ta_new的时候，返回了TD_NOLIBTHREAD，所 以没有装载target&multi-thread&。 在时候我就怀疑是不是libpthread有问题，于是检查了一下发现了问题，这个环境中的libpthread是被strip过的，我想可能 就是以为这个影响了td_ta_new对libpthread符号信息的获取。当我换了一个没有strip过的libpthread的时候，问题果然解决 了。 最终我的解决办法是拷贝了一个.debug版本的libpthread到lib目录中，问题解决了。 多线程如果dump，多为段错误，一般都涉及内存非法读写。可以这样处理，使用下面的命令打开系统开关，让其可以在死掉的时候生成core文件。 ulimit -c unlimited这样的话死掉的时候就可以在当前目录看到core.pid(pid为进程号)的文件。接着使用gdb:gdb ./bin ./core.pid 进去后，使用bt查看死掉时栈的情况，在使用frame命令。还有就是里面某个线程停住，也没死，这种情况一般就是死锁或者涉及消息接受的超时问题(听人说的，没有遇到过)。遇到这种情况，可以使用：gcore pid （调试进程的pid号）手动生成core文件，在使用pstack(linux下好像不好使)查看堆栈的情况。如果都看不出来，就仔细查看代码，看看是不是在if，return，break，continue这种语句操作是忘记解锁，还有嵌套锁的问题，都需要分析清楚了。本文来自ChinaUnix博客，如果查看原文请点： 　 (共有条评论)
有不一样的发现
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提了一个问题
XP控制面板用户账户无法打开，有两种情况，一个是真
“运行”中输入“sfc /scannow”确定（sfc后面是空格）1、开始 –所有程序—附件—系统工具—系统还原—打开“欢迎使用系统还原”对话框；&2、选“恢复我的计算机到一个较早的时间”—下一步，打开“选择一个还原点”对话框；&3、单击你认为运行正常的一个日期为还原点---下一步打开“确认还原点”对话框；&4、确认后，点击下一步，系统会进行还原；&5、成功后会通知你，确定退出。方法2:点开始--运行然后输入gpedit.msc 用户配置--管理模板--桌面和控制面板两项把里面全部都设置为：未被配置">...
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提了一个问题
网站速度，笔者总结了一些切实可行的方法，制作主页
<span data-text="网站速度，笔者总结了一些切实可行的方法，制作主页时，以下的方法可以令你的网页速度大大提高。　　一.记得帮页面减肥　　我们浏览网页实际上是将虚拟主机中的网页内容下载到本地硬盘，再用浏览器解释查看的。下载网页的快慢在显示速度上占了很大比重，所以，网页本身所占的空间越小，那么浏览速度就会越快。这就要求在做网页的时候遵循一切从简的原则，如:不要使用太大的Flash动画、图片等资源。干净、简洁的页面会给人一种思路明朗的感觉。　　二、如没必要，尽量使用静态HTML页面　　众所周知，ASP、PHP、JSP等程序实现了网页信息的动态交互，运行起来的确非常方便，因为它们的数据交互性好，能很方便地存取、更改数据库的内容，使网站“动”起来，如:论坛、留言板等。但是这类程序必须先由服务器执行处理后，生成HTML页面，然后再“送”往客户端浏览，这就不得不耗费一定的服务器资源。如果在虚拟主机上过多地使用这类程序，网页显示速度肯定会慢，所以没有必要，请尽量使用静态的HTML页面。 这一点可以参考/home.htm　　三、切忌将整个页面内容塞到一个Table中　　这是网页设计的问题了，很多站长为了追求页面统一对齐，将整个页面的内容都塞进了一个Table(表格)里，然后再由单元格td来划分各个“块”的布局，这种网站的显示速度是绝对慢的。因为Table要等里面所有的内容都加载完毕后才显示出来的，如果某些内容无法访问，就会拖延整个页面的访问速度。正确的做法是:将内容分割到几个具有相同格局的Table中去，不要全都塞到一个Table里。　　四.将ASP、ASPX、PHP等文件的访问改为.js引用。　　这在ASP、ASPX、PHP等程序设计时应该注意的，如果你要在静态的HTML页面里嵌入动态的数据，而这些动态的数据是由ASP、PHP等程序来提供的话，会使用以下的语句引用:，这样的话，每次有一个人访问你的网站，服务器就要执行并处理一次tongji.asp文件，从数据库抽取相应的数据，再输出给网页显示，如果有几万个人同时访问，就要执行几万次，后果就可想而知。建议在这些程序中将数据动态生成到一个1.js文件中去，然后在首页通过 这样的代码来引用该1.js文件。这样，数据显示的任务就交给客户端的浏览器去做，不会耗费服务器的资源，显示速度自然就很快;笔者的网站&&下的home.htm文件，里面有大量的js引用，js的内容通过后台程序自动生成的，这样访问的速度就非常快了。　　五.使用iframe嵌套另一页面。　　如果你要在网站上插入一些广告代码，又不想让这些广告网站影响速度的话，那么，使用iframe最合适不过了。方法是:将这些广告代码放到一个独立的页面去，然后在首页用如下的代码将该页面嵌入即可，这样就不会因为广告页面的延迟而拖了整个首页的显示，代码如下:＜iframe align="center" width="780" height="30" name="all" scrolling="no" marginWidth=0 frameborder="0" src=＞＜/iframe＞　　其中&就是被引用的文件路径。　　六.讲究网站计数器代码放置的技巧　　在网页里放置计数器可以统计网站的访问流量，为站长和广告商家提供访问依据，但是，不管功能有多强大的网站统计系统，都会有出故障的时候。如果直接把统计代码放到页面内容的前面，或者放在一个Table或者div标签里，那么在计数器不能访问的时候，你的页面上那个Table或者div就会产生几十秒钟的延迟，导致页面很长时间才能访问。所以，要提高网站的速度，就要讲究统计代码放置的位置，正确的方法是:把统计代码放到页面的最下面，并且不要和页面内容同在一个Table或者div标签里。可以在页面代码的最下方直接放置统计代码，或者在最下方单独做一个Table或者div来放置计数器。这样，在计数器不能访问的时候，你的网站速度也不会受到丝毫影响。　　七.友情链接的学问　　网站之间互相做链接可以增加网站的宣传效果，做LOGO图片链接更能准确地描述网站的主题和定位，宣传效果会大大的增强，但图片链接做得太多，必然会影响网页的显示速度。很多站长都喜欢直接引用友情网站上的图片URL，这样图片要先经过加载才能显示的，各个友情网站的访问速度不一样，整个表格都要等图片都下载完了才能显示出来，这样大大降低了网页的速度。因此，做友情链接时应尽量做到:　　1.只做文字链接:做文字链接是不会延迟网页速度的。　　2.将所有链接放到一个独立的分页去，然后在首页链接上该页。　　3.如果友情链接一定要出现在首页，请将链接所在的整个Table放到页面的最下方，因为页面是由上到下逐行显示的，将其放到页面的最下方，不会延迟其他内容的显示。　　4.友情链接的LOGO图片先下载后再传到自己的网页空间，这样，速度由自己的网站空间决定而不受友情网站的影响。　　总之，网站速度优化还有很多途径，尤其是在网站建设初期的架构上要多采用静态页面展现+的架构，只有这样才能从根本上提高网站访问速度。">...
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<span data-text="网站速度，笔者总结了一些切实可行的方法，制作主页时，以下的方法可以令你的网页速度大大提高。　　一.记得帮页面减肥　　我们浏览网页实际上是将虚拟主机中的网页内容下载到本地硬盘，再用浏览器解释查看的。下载网页的快慢在显示速度上占了很大比重，所以，网页本身所占的空间越小，那么浏览速度就会越快。这就要求在做网页的时候遵循一切从简的原则，如:不要使用太大的Flash动画、图片等资源。干净、简洁的页面会给人一种思路明朗的感觉。　　二、如没必要，尽量使用静态HTML页面　　众所周知，ASP、PHP、JSP等程序实现了网页信息的动态交互，运行起来的确非常方便，因为它们的数据交互性好，能很方便地存取、更改数据库的内容，使网站“动”起来，如:论坛、留言板等。但是这类程序必须先由服务器执行处理后，生成HTML页面，然后再“送”往客户端浏览，这就不得不耗费一定的服务器资源。如果在虚拟主机上过多地使用这类程序，网页显示速度肯定会慢，所以没有必要，请尽量使用静态的HTML页面。 这一点可以参考/home.htm　　三、切忌将整个页面内容塞到一个Table中　　这是网页设计的问题了，很多站长为了追求页面统一对齐，将整个页面的内容都塞进了一个Table(表格)里，然后再由单元格td来划分各个“块”的布局，这种网站的显示速度是绝对慢的。因为Table要等里面所有的内容都加载完毕后才显示出来的，如果某些内容无法访问，就会拖延整个页面的访问速度。正确的做法是:将内容分割到几个具有相同格局的Table中去，不要全都塞到一个Table里。　　四.将ASP、ASPX、PHP等文件的访问改为.js引用。　　这在ASP、ASPX、PHP等程序设计时应该注意的，如果你要在静态的HTML页面里嵌入动态的数据，而这些动态的数据是由ASP、PHP等程序来提供的话，会使用以下的语句引用:，这样的话，每次有一个人访问你的网站，服务器就要执行并处理一次tongji.asp文件，从数据库抽取相应的数据，再输出给网页显示，如果有几万个人同时访问，就要执行几万次，后果就可想而知。建议在这些程序中将数据动态生成到一个1.js文件中去，然后在首页通过 这样的代码来引用该1.js文件。这样，数据显示的任务就交给客户端的浏览器去做，不会耗费服务器的资源，显示速度自然就很快;笔者的网站&&下的home.htm文件，里面有大量的js引用，js的内容通过后台程序自动生成的，这样访问的速度就非常快了。　　五.使用iframe嵌套另一页面。　　如果你要在网站上插入一些广告代码，又不想让这些广告网站影响速度的话，那么，使用iframe最合适不过了。方法是:将这些广告代码放到一个独立的页面去，然后在首页用如下的代码将该页面嵌入即可，这样就不会因为广告页面的延迟而拖了整个首页的显示，代码如下:＜iframe align="center" width="780" height="30" name="all" scrolling="no" marginWidth=0 frameborder="0" src=＞＜/iframe＞　　其中&就是被引用的文件路径。　　六.讲究网站计数器代码放置的技巧　　在网页里放置计数器可以统计网站的访问流量，为站长和广告商家提供访问依据，但是，不管功能有多强大的网站统计系统，都会有出故障的时候。如果直接把统计代码放到页面内容的前面，或者放在一个Table或者div标签里，那么在计数器不能访问的时候，你的页面上那个Table或者div就会产生几十秒钟的延迟，导致页面很长时间才能访问。所以，要提高网站的速度，就要讲究统计代码放置的位置，正确的方法是:把统计代码放到页面的最下面，并且不要和页面内容同在一个Table或者div标签里。可以在页面代码的最下方直接放置统计代码，或者在最下方单独做一个Table或者div来放置计数器。这样，在计数器不能访问的时候，你的网站速度也不会受到丝毫影响。　　七.友情链接的学问　　网站之间互相做链接可以增加网站的宣传效果，做LOGO图片链接更能准确地描述网站的主题和定位，宣传效果会大大的增强，但图片链接做得太多，必然会影响网页的显示速度。很多站长都喜欢直接引用友情网站上的图片URL，这样图片要先经过加载才能显示的，各个友情网站的访问速度不一样，整个表格都要等图片都下载完了才能显示出来，这样大大降低了网页的速度。因此，做友情链接时应尽量做到:　　1.只做文字链接:做文字链接是不会延迟网页速度的。　　2.将所有链接放到一个独立的分页去，然后在首页链接上该页。　　3.如果友情链接一定要出现在首页，请将链接所在的整个Table放到页面的最下方，因为页面是由上到下逐行显示的，将其放到页面的最下方，不会延迟其他内容的显示。　　4.友情链接的LOGO图片先下载后再传到自己的网页空间，这样，速度由自己的网站空间决定而不受友情网站的影响。　　总之，网站速度优化还有很多途径，尤其是在网站建设初期的架构上要多采用静态页面展现+的架构，只有这样才能从根本上提高网站访问速度。">...
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