snp基因分型原理检测可以检测到什么

华大基因SNP分型检测服务升级了 | 华大基因 -生物通
&&&&&&华大基因采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术进行SNP基因分型检测服务。华大基因一直以雄厚的技术实力和丰富的检测经验为客户提供优质的SNP基因分型检测服务,而今华大基因又重磅推出增值服务――疾病关联分析服务。
最实惠的价格,最先进的技术,最全面的服务。
&&&&&&1.性价比高:位点越多,价格越优惠。
&&&&&&2.一流的技术平台:飞行时间质谱平台及Mass
ARRAY-iPEX技术。
&&&&&&3.疾病关联性分析:生物信息学统计和专业分析。
&&&&&&4.严谨的管理:严格的临床管理系统,保障客户的样本和样本信息完好。
&&&&&&5.完整的实验数据系统:SNP位点分析报告样本检测报告、SNP分型数据分析报告、SNP分型检测服务质量控制报告、疾病关联分析报告。
&&&&&&利用样品分子在电场中的飞行时间与分子的质荷比成正比的原理,通过检测样品分子的飞行时间,测得分子量,推知SNP位点。
SNP分型检测技术优势
准确率高、灵活性强、通量大、检测周期短、成本低。
数据分析优势
快捷、准确、标准化。
&&&&&&1.已知位点检测
&&&&&&&&&◆基因突变检测(如:耐药位点检测)
&&&&&&&&&◆遗传疾病研究
&&&&&&&&&◆微生物分型检测
&&&&&&&&&◆新药研发
&&&&&&&&&◆动植物遗传育种优良基因筛选
&&&&&&2.未知位点检测
&&&&&&&&&◆外显子测序及重测序后对有意义的SNP位点进行大样本量验证检测
&&&&&&3.数据分析
&&&&&&&&&◆质量控制
&&&&&&&&&◆哈迪温伯格平衡
&&&&&&&&&◆单个位点关联分析
&&&&&&&&&◆单个位点数量性状的分析
&&&&&&&&&◆多重校验
&&&&&&&&&◆单体型分析
&&&&&&&&&◆LD计算
&&&&&&&&&◆power计算、OR值计算、单体型推断、分层分析、重组率估计
&&&&&&1.SNP分型检测
&&&&&&2.数据分析
反应数量(SNP位点数×样品数)
高原50个外显子组测序项目
某医院胃癌致病基因验证检测
某医学院高度近视分型检测
人基因组DNA
130×350(一期)
40×1200(二期)
某大学种猪优良基因筛查
66×350 (一期)
45×900 (二期)
某林业所杨树优良基因检测
某动物研究所蚊子基因分型检测
蚊子基因组DNA
某医院鼻炎分型检测
人基因组DNA
服务热线: 400-706-6615
地址:广东省深圳市盐田区北山工业区综合楼(邮编518083)
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更灵活经济的SNP检测方法:KASP法
作者:MedSci&&&来源:MedSci
&&& 便宜而准确的基因SNP分型方法一直是遗传学家追求的手段。LGC公司出品的KASP方法,可以用2个荧光探针、2个通用淬来探针,再加多个位点特异探针来检则多个SNP位点。
只要合成两个通用荧光探针,两个通用淬灭探针,再加合成多个针对具体位点的SNP PCR引物,就可以测许多位点
因为荧光探针、和淬灭探针都很贵,KASP方法相比于Taqman方法,可以通过通用荧光探针来代替针对位点的荧光探针,大大节约成本
设计2个SNP PCR引物,各对应于一个SNP的等位基因,如图:
Allele 1引物3'末端是C;allele 2引物3'末端是A标签序列
Allele 1引物5'末端是F序列;allel 2引物5'末端是H标签序列
设计荧光探针
F探针与Allele 1标签序列一致;H探针与Allele 2标签序列一致
F探针的5'端有一个FAM荧光基团;H探针的5'端有一个HEX荧光基团
相应于F探针和H探针,各设计一个3'端带淬灭基团的淬灭探针
第一轮PCR,模板会与可互补的(3'末端能配对的)PCR引物进行退火,并发生扩增。
这步完成SNP识别
第2轮PCR扩增,扩增出带有标签序列的PCR产物
这步完成把通用标签序列引入与SNP对应的PCR产物
经过接下来几轮的PCR扩增,一方面淬灭探针被切碎,另一方面荧光探针更多地退火到新合成的、没有淬灭基团的互补链上,发出荧光
通过检测荧光,检出SNP位点上是哪个碱基实验流程主要包括:
& o 准备:1)两条末端碱基不同的等位基因正向引物与一条反向引物构成的Primer Mix,两条正向引物5’端分别连有不同序列的检测引物序列;2)带有不同荧光的两条检测引物Master Mix;3)DNA 模板
& o PCR反应I:变性模板与Primer Mix中相匹配的引物结合并退火,延伸后序列被加上了检测引物的序列;
& o PCR反应II:等位基因特异性的末端序列的互补链合成;
& o PCR反应III:信号产生---特异序列对应的检测引物随PCR反应进行指数性增长,相应信号被检测。  由于SNPline的高度灵活性,其应用也十分广泛,适合于各种基因分型研究,无论是低通量研发项目,NGS之后的SNP验证,农业种群研究,还是QC和DNA Biobanking等都是其适用的范围。
  最适合自己实验要求的,就是最好的实验平台,LGC KASP技术,为您解除大样本量SNP分型实验的困扰。
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