XCrySDeniso文件怎么安装求助

博客访问: 695937
博文数量: 281
博客积分: 7225
博客等级: 少将
技术积分: 5083
注册时间:
IT168企业级官微
微信号:IT168qiye
系统架构师大会
微信号:SACC2013
XCrySden是一个量化常用的图形软件:下载地址
如果想在WINDOWS下安装XCrySden需要先安装LINUX的WINDOWS虚拟软件 CYGWIN
具体安装CYGWIN网络上资料非常多,但是安装XCrySden需要如下程序包
________________________________________________________________________
* * * README for running XCRYSDEN under CYGWIN * * *
________________________________________________________________________
1. SOFTWARE REQUIREMENTS
To run XCrySDen (pre-compiled) package under CYGWIN you will need the
following cygwin packages:
* coreutils
* ImageMagick
Note that the cygwin version of xcrysden does not require X-server
(i.e. xorg-server).
2. RUNNING DIRECTLY FROM WINDOWS
You can create an xcrysden launcher (icon) on the Windows desktop as
1. edit the file "xcrysden.bat" so as to specify the locations of
cygwin and xcrysden installations.
2. copy the so-edited "xcrysden.bat" to desktop
You should execute the following command when you use XCrySDen for the first time.% xcConfigure $XCRYSDEN_TOPDIRPlease answer the questions.Do you have a CRYSTAL-95/98/03 package ([y]es/[n]o): nSpecify printing command (default: lpr -h): lprDo you want to enable the "babel" program ([y]es/[n]o): nDo you want to enable the ImageMagick's "convert" program ([y]es/[n]o): yWhich image conversion program (default: /app/local/bin/convert):Do you want to enable the "whirlgif" program ([y]es/[n]o): nDo you want to enable the "mpeg_encode" program ([y]es/[n]o): nIt is possible to change the setting by modifying $HOME/.xcrysden/custom-definitions file.Please execute the following command to start the XCrySDen.% xcrysden&
阅读(5378) | 评论(1) | 转发(1) |
相关热门文章
给主人留下些什么吧!~~
你好,我在windows上安装完了之后,编译了这文件,放到桌面上,但是双击之后确实出来要加载的一个黑色框,但是等xcrysden马上要出来的时候一闪就没了。也没有真正加载起来!说以还要进CYGWIN,并且每次进去都要source .bashrc一下,才能找到xcrysden命令!不知道为什么。感觉不是很方便!有没有办法直接双击一个图标,就能去启动起来xcrysden啊?谢谢(如果有回复到我的邮箱吧!谢谢了)
1. edit the file "xcrysden.bat" so as to specify the locations of
cygwin and xcrysden installations.
2. copy the so-edited "xcrysden.bat" to desktop
请登录后评论。小木虫 --- 600万学术达人喜爱的学术科研平台
热门搜索:
&&请教xcrysden的安装
请教xcrysden的安装
自己试着装了装,但是还是没装好。WINDOWS版本,下载并安装了cygwin和Xcrysden。但是使用w2web登录服务器时,
View structure with XCrysDen, 显示的是Requires X-Windows system ...
希望大侠们能够指导安装,安装成功可以继续增加奖励,谢谢大侠们了。
额,能否给个QQ,详细请教一下,呵呵呵。这个安装过程不是我进行的,所以对这个过程很不熟悉,我QQ,麻烦您了。
在linux下安装完以后就可以在w2web上直接显示了么?
不了解你说的w2web是啥,反正我把xcrysden装在服务器上,用xmanger命令窗口输入xcrysden就可以在客户端系统显示图形界面了。
学术必备与600万学术达人在线互动!
扫描下载送金币小木虫 --- 600万学术达人喜爱的学术科研平台
热门搜索:
&&【活动】XCrySDen在windows下的安装与问题解决
【活动】XCrySDen在windows下的安装与问题解决
XCrySDen在Windows下安装很多时候就像是中彩票一样,我以前装过很多都好好的,最近在装的时候总是出现莫名其妙的问题。
这里希望大家把自己遇到的错误与解决方法贴出来,一起交流问大家以后安装cygwim版本的XCrySDen提供方便。奖励只给提供了有价值信息的虫友。希望大家爱踊跃参加!!
我先开个头:
软件版本是 XCrySDen 1.5 cygwin shared bin
系统是 windows7 64bit
基本安装要求:
cygwin,和XCrySDen的安装包就足够了
但是在安装cygwim的时候,除了默认的最基本的外还需要把以下软件包安装:
ImageMagick
以及所有的X11的内容
安装的时候还会提示一些必须安装的东西,这些能装的就装,搜不到的就不用管了。
安装的时候,会有各种问题的出现,下面我列举几条,已经解决的方法:
Application initialization failed: couldn't connect to display "127.0.0.1:0.0"
Error in startup script: couldn't connect to display "127.0.0.1:0.0"
& & while executing
"load /usr/lib/tk8.5/../../bin/libtk8.5.dll Tk"
& & ("package ifneeded Tk 8.5.11" script)
& & invoked from within
"load $system(TOPDIR)/bin/xcrys.dll"
& & invoked from within
"if {&&} {
& & load $system(TOPDIR)/bin/xcrys.dll
& & (file "/home/zhouych/XCrySDen-1.5.18-bin-shared/Tcl/xcInit.tcl" line 426)
这个错误很多人应该有过,可能是大家出错最多的提示,如果真的提示这一步其实你已经很幸运了,离安装成功之差一步,这要做如下更改后就可以正常运行XCrySDen,修改如下:
1, 在~/.bashrc中加入以下内容
& & DISPLAY=127.0.0.1:0.0; export DISPLAY& &
(这个也可以解决提示warming Application initialization failed: no display name and no $DISPLAY environment……)
2.&&然后source ~/.bashrc
3.&&如果全部安装了X11模块,在开始菜单中应该会有
& & Cygwim-x的xWin-server,运行这个程序,
4 然后再运行
& & ./xcrysden
第二个问题一般是
Error in startup script: can't read "tk_version": no such variable
& & while executing
"package provide Tk $tk_version"
这个说明你没有安装 tcl-tk模块,或者对应的环境变量没有写对,卸载重新安装即可。
第三个问题是
$tk_version, conflict, 8.5, 8.5.11具体的提示忘了,大概就是说我安装了两个,就会有两个version,冲突了。
这个可以直接修改xcInit.tcl文件,找到400行,直接给tk_version赋值一个确定的值如8.5.11。
或者删除其中一个版本
我也遇到这个问题,请问怎么解决的?谢谢
学术必备与600万学术达人在线互动!
扫描下载送金币新手园地& & & 硬件问题Linux系统管理Linux网络问题Linux环境编程Linux桌面系统国产LinuxBSD& & & BSD文档中心AIX& & & 新手入门& & & AIX文档中心& & & 资源下载& & & Power高级应用& & & IBM存储AS400Solaris& & & Solaris文档中心HP-UX& & & HP文档中心SCO UNIX& & & SCO文档中心互操作专区IRIXTru64 UNIXMac OS X门户网站运维集群和高可用服务器应用监控和防护虚拟化技术架构设计行业应用和管理服务器及硬件技术& & & 服务器资源下载云计算& & & 云计算文档中心& & & 云计算业界& & & 云计算资源下载存储备份& & & 存储文档中心& & & 存储业界& & & 存储资源下载& & & Symantec技术交流区安全技术网络技术& & & 网络技术文档中心C/C++& & & GUI编程& & & Functional编程内核源码& & & 内核问题移动开发& & & 移动开发技术资料ShellPerlJava& & & Java文档中心PHP& & & php文档中心Python& & & Python文档中心RubyCPU与编译器嵌入式开发驱动开发Web开发VoIP开发技术MySQL& & & MySQL文档中心SybaseOraclePostgreSQLDB2Informix数据仓库与数据挖掘NoSQL技术IT业界新闻与评论IT职业生涯& & & 猎头招聘IT图书与评论& & & CU技术图书大系& & & Linux书友会二手交易下载共享Linux文档专区IT培训与认证& & & 培训交流& & & 认证培训清茶斋投资理财运动地带快乐数码摄影& & & 摄影器材& & & 摄影比赛专区IT爱车族旅游天下站务交流版主会议室博客SNS站务交流区CU活动专区& & & Power活动专区& & & 拍卖交流区频道交流区
白手起家, 积分 0, 距离下一级还需 200 积分
论坛徽章:0
刚刚安装了XCrySDen 软件,本来一开始是想看vasp的结果的,但是不知道怎么看,yangjinrong_lon兄要是用过,不妨过来说说
这个软件的下载网址是
里面有各种版本的,我安装的是xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz版本,我已经安装过,显示没有问题,安装过程比较简单,因为是tar文件所以不用安装,只需要设置一些环境变量即可。
下载次数: 37
下面是安装过程:
1.首先解压缩tar文件 tar zxvf xc-1.5.17-xc-1.5.17-linux_x86-semishared.tar.gz.tar.gz
2. 进入XCrySDen-1.5.17-bin-semishared文件夹,执行./xcConfigure.sh 然后会问你一些问题,你只要简单的选择Y和N就行了。
3. 设置环境变量 vi .bashrc
XCRYSDEN_TOPDIR=/public/all/XCrySDen-1.5.17-bin-shared
XCRYSDEN_SCRATCH=/tmp/XCRYSDEN_SCRATCH
export XCRYSDEN_TOPDIR XCRYSDEN_SCRATCH
PATH=&$XCRYSDEN_TOPDIR:$PATH:$XCRYSDEN_TOPDIR/scripts:$XCRYSDEN_TOPDIR/util&
4.保存bashrc 文件
&&source .bashrc
5.运行,只需输入xcrysden即可 ,linux系统需要x显示软件,比如xwin,exceed,Xmanager等等
6.在配置过程中,会告诉你要实现一些功能需要哪些额外的软件,下面是地址,有兴趣的可以去下载
XCRYSDEN uses a few external utility programs. These are the following:
& &1.) the &Open Babel& program is needed to display molecular structure from
& && & Gaussian Z-matrix file.
& &2.) the ImageMagick's suit of programs is used to print-to-file (PNG/JPG/GIF/...),
& && & to create animated-GIFs, and to screen dump windows.
& &3.) the &Mplayer's mencoder& program is used to create AVI/MPEG movies
& && & from the animation snapshots.
& &4.) xcrysden may also use other programs such as gifsicle, xwd, ppmtompeg, ...
& &Open BABEL:&&
& &IMAGEMAGICK:
& &MENCODER:& &
7.功能简单介绍,下面是转载量子化学网的描述&&
  显示晶体和分子的结构和电子密度程序。它还可以处理倒格子空间的特性,如绘制能带结构图,显示Fermi面,等。
晶体和分子的特性分析(如,原子上的力)
显示分子模型(线图,棒图,球棍模型,曲面模型......;转动,平移,放大......)
测量模型的键长,键角和二面角
显示晶体的Wigner-Seitz晶胞和布里渊区
读取标准格式的分子结构文件:XYZ,PDB,XSF
提供晶体从头计算程序CRYSTAL的图形用户界面
晶体从头计算程序WIEN的晶体结构可视化,产生二维/三维电子密度,生成用于键结构图的k-网格
显示从头计算程序GAUSSIAN,CRYSTAL,PWSCF,WIEN,FHI98MD计算的结构
XCrySDen 1.6的新功能:
1. 兼容Quantum-Espresso 4.x,WIEN2k_08,和CRYSTAL06。
2. 支持几种电影编码器。
3. 改善了测量过程,选择原子更容易。
4. 实时获取显示图像,存为电影。
5. 鼠标滚轮支持缩放显示。
6. 简化了安装过程。
原帖地址:http://forum.hongcam.net/viewthread.php?tid=510&extra=page%3D1
本文来自ChinaUnix博客,如果查看原文请点:
&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp&&nbsp|&&nbsp
北京盛拓优讯信息技术有限公司. 版权所有 京ICP备号 北京市公安局海淀分局网监中心备案编号:22
广播电视节目制作经营许可证(京) 字第1234号
中国互联网协会会员&&联系我们:
感谢所有关心和支持过ChinaUnix的朋友们
转载本站内容请注明原作者名及出处}

我要回帖

更多关于 mysql安装 的文章

更多推荐

版权声明:文章内容来源于网络,版权归原作者所有,如有侵权请点击这里与我们联系,我们将及时删除。

点击添加站长微信