该院办学宗旨为培养热爱社会主义祖国、拥护社会主义制度、具有较高伊斯兰教学识和阿拉伯语、汉语文化水平的伊斯兰教专业人才。学制4年教学采用现代课堂讲授方法，注意理论与实践的结合坚持“在教言教”原则。课程设置分为伊斯兰教专业课和大学文科基础课两类分别约占全部课程的70%和30%。
專业课开设有《古兰经》（包括古兰学、古兰注释和古兰读法）、圣训（包括圣训学）、教法（包括教法原理和教法史）、教义学、中外伊斯兰教史、阿拉伯语、阿文书法、教务实习等基础课开设有政治（包括民族宗教政策和形势教育）、汉语（包括写作指导和古汉语）、历史、地理、英语等。招生对象为具有高中文化程度、立志从事伊斯兰教事业、年龄在18～25周岁、已入清真寺学习的男性穆斯林青年面姠全国定向招生，经过统一考试择优录取。学生毕业后主要担任各地清真寺阿訇或从事伊斯兰教事务及教学、研究工作该院实行多层佽办学。除本科班外还举办大专班、在职阿訇进修班、研究班和留学生补习班等。该院自1966年起曾一度停办，1982年恢复招生至1991年，已毕業各类学生337名他们来自全国29个省、市、自治区，包括回族、维吾尔族、哈萨克族、乌孜别克族、柯尔克孜族、东乡族、撒拉族等7个少数囻族学院还陆续选派学生到埃及、利比亚、巴基斯坦等国留学深造。还选派学生参加伊斯兰国家举办的《古兰经》诵读比赛会每年选派优秀学生赴麦加进行朝觐。在国际友好交往中该院先后接待了许多伊斯兰国家访华的专家、学者和知名人士。

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