有清一代，中央政府极为重视对于蒙、藏地区的统治，尤为重视对黄教教首的笼络和控制。清代中国，广大蒙藏地区共有“四大活佛”。第一、达赖喇嘛。五世达赖于清顺治九年，公元1652年进京觐见顺治帝，初步确认了清中央政府的宗主权。年仅16岁的顺治帝在与五世达赖会谈中，表现甚为得体，从此之后，清朝皇帝被藏地僧俗大众奉为“文殊菩萨”的化身！清中央在西藏地方确立了崇高的威望。西藏布达拉宫红宫最高处殿内供有康熙皇帝、乾隆皇帝的画像和用汉、藏、蒙、满四种文字所写的清朝皇帝的牌位，每年达赖必到这里朝拜，以表达对清朝皇帝的君臣关系。布达拉宫殊胜三界殿供奉 清·康熙 康熙皇帝长生牌位自七世达赖喇嘛开始，每逢藏历新年初一和皇帝生日，都要到此朝拜康熙帝长生牌位。布达拉宫殊胜三界殿供奉 清·乾隆皇帝画像公元1762年，在八世达赖喇嘛降白嘉措举行坐床典礼时，乾隆帝派专使携带大量礼品入藏赐予八世达赖喇嘛。其中，最具历史意义的就是这幅乾隆皇帝画像唐卡。此后的八世、九世班禅，十世、十一世、十二世达赖喇嘛“转世灵童”的金瓶掣签仪式，在清中央驻藏大臣和西藏地方政府官员的共同主持下，均在这幅皇帝画像前举行。第二、班禅额尔德尼。1713年，康熙帝册封班禅大师为“班禅额尔德尼”称号，并确认了班禅在后藏地区的最高地位。乾隆四十五年，公元1780年，六世班禅不远万里至承德避暑山庄觐见乾隆帝，恭祝乾隆帝七十大寿。为此，乾隆帝命人仿照后藏日喀则扎什伦布寺建须弥福寿之庙，至今仍为承德景区之名胜。班禅在避暑山庄的一个多月期间，乾隆帝多次亲自接见，并以藏语与之交流（乾隆帝精通五种语言），班禅大为惊讶和感动。后来，六世班禅病逝于北京西黄寺。通过这一系列事件，清廷大大巩固了中央政府在遥远后藏地区的统治。第三，哲布尊丹巴呼图克图。清代至现代为止，喀尔喀蒙古地区最高宗教领袖。九世哲布尊丹巴于2012年在乌兰巴托圆寂。最早的哲布尊丹巴全部出自喀尔喀蒙古汗王土谢图汗家族。公元1756年，由于乾隆帝赐死了同情准噶尔帝国的额琳沁多尔济——黄金家族直系后裔，引起蒙古王公的不满。喀尔喀蒙古遂发生“撤驿之变”，外蒙王公集体抵制乾隆帝派往新疆的大军，撤除驿站、烧毁粮草、发动叛乱，严重威胁清军后路。乾隆帝沉着冷静，迅速派大军平定了叛乱，并处决了发起叛乱的外蒙王公青衮扎布。由于哲布尊丹巴在叛乱初起时，对叛乱的蒙古王公表示同情，引起乾隆帝极大的不满，故在平息叛乱后，乾隆下旨不准哲布尊丹巴在当地寻找转世灵童，改为在四川理塘寻转，从此杜绝了蒙古王公对哲布尊丹巴转世的控制，并设置库伦办事大臣，加强了在外蒙地区的统治。第四，章嘉胡图克图。清代至民国，内蒙地区最高宗教领袖。第一世章嘉胡图克图于康熙年间奉诏驻北京法源寺，康熙帝命其掌管漠南蒙古宗教事务。三世章嘉活佛从小与幼年的乾隆帝在书房伴读，感情极深。“撤驿之变”时奉乾隆帝之命，利用自身在广大蒙古地区的宗教影响力，劝谕外蒙哲布尊丹巴活佛及众蒙古王公不要支持叛乱，立下汗马功劳。公元1746年，西藏发生珠尔墨特叛乱（珠尔墨特为当地王公，奉命掌管西藏地方事务），杀死驻藏大臣，清廷迅速派军平定。事件发生后，乾隆帝盛怒难消，决意在西藏实行郡县制，一举废除藏地的政教体制。三世章嘉活佛知道后，在乾隆帝面前长跪不起，希望皇帝能保留藏地特殊的宗教习俗——“因俗而治”，最终，乾隆帝收回了圣命。最后一任章嘉呼图克图于1939年病逝于四川。有清一代，清中央对于此“四大活佛”的安抚和控制极为严密，从而保证了广大蒙藏地区的长治久安。}