&& 查看话题
A类和B类错误解决
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.843&&
PLAT214_ALERT_2_B Atom O4& && &(Anion/Solvent) ADP max/min Ratio& && && & 5.5 prola
该如何解决啊~~~
B类错误是氧的震动倍数太大了，不行就做个无序！ 貌似是完整度太低，重新收数据吧，个人建议，仅供参考
可以看看陈小明的那本书 A类错误代表完整度太低，可以试着用omit命令。 可以还原的时候，把数值改到0.75
在ins 里面加omit 0 50
第二个，可以试试 isor 0.001 O4
试试看 挺好解决的，
A类错误只需要在精修的时候设定一下Omit的两个参数
B类错误只需要把晶体的分子式改正确就行 : Originally posted by lindaxcy at
可以还原的时候，把数值改到0.75
在ins 里面加omit 0 50
第二个，可以试试 isor 0.001 O4
试试看 第一个试了这个还是没用哦，第二个试了你这个方法以后那个B类错误是解决了，但是多出几个A类错误了，
PLAT214_ALERT_2_A Atom O6& && &(Anion/Solvent) ADP max/min Ratio& && && & 6.5 prola
PLAT342_ALERT_3_A Low Bond Precision on&&C-C Bonds ...............& &&&0.1594 Ang&&
PLAT602_ALERT_2_A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure& && &&&!
PLAT722_ALERT_1_A Angle& &Calc& && &105.00, Rep& &&&100(10) Dev...& && & 5.00 Deg.
& && && && &&&O6& &-CL2&&-O6& && &1.555& &1.555& &3.665& && &#& && && &51& && &
PLAT722_ALERT_1_A Angle& &Calc& && &105.00, Rep& &&&100(10) Dev...& && & 5.00 Deg.
& && && && &&&O6& &-CL2&&-O6& && &6.555& &1.555& &8.665& && &#& && && &52
而且GOOF值飙升到9了，请问这样情况该怎么处理呢？ 可以将
acta 50 看看 那就是还原数据的时候，有个参数需要改一下，改成0.75，会影响信号的强度，但是完成度会提高 估计是数据还原的的问题，重新还原一下吧
另外遇到你说的那个a错，估计是isor的太厉害了吧，
isor 0.01 O4 O6试试，goof值可以通过算权重下来的， : Originally posted by soso800120 at
acta 50 看看 这个命令试过几次，都能解决错误，但一直不明白什么意思，想问一下，这个命令的作用是什么，谢谢了&& 查看话题
晶体有很多A类和B类的错误，能投非晶体的文章吗
我的化合物是很容易风化的，我是封管测的，由于含有六氟磷酸根，所以无序很厉害，我们老师已经帮我求助高手解过了，不过还是有很多A类、B类的错误，这是Checkcif给的信息，大家帮我想想办法呢
Alert level A
SHFSU01_ALERT_2_A The absolute value of parameter shift to su ratio > 0.20
Absolute value of the parameter shift to su ratio given 2.198
Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................ 2.20
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C20 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?
PLAT211_ALERT_2_A ADP of Atom C28 is N.P.D. or (nearly) 2D ... ?
PLAT213_ALERT_2_A Atom N2 has ADP max/min Ratio ..... 6.8 prola
PLAT234_ALERT_4_A Large Hirshfeld Difference C12 -- C19 .. 0.32 Ang.
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O3
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O10
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O11
PLAT306_ALERT_2_A Isolated Oxygen Atom (H-atoms Missing ?) ....... O12
PLAT430_ALERT_2_A Short Inter D...A Contact O11 .. O12 .. 1.96 Ang.
Alert level B
RFACR01_ALERT_3_B The value of the weighted R factor is > 0.35
Weighted R factor given 0.380
PLAT026_ALERT_3_B Ratio Observed / Unique Reflections too Low .... 38 Perc.
PLAT084_ALERT_2_B High wR2 Value ................................. 0.38
PLAT111_ALERT_2_B ADDSYM Detects (Pseudo) Centre of Symmetry ..... 85 PerFi
PLAT214_ALERT_2_B Atom O3 (Anion/Solvent) ADP max/min Ratio 5.5 prola
PLAT234_ALERT_4_B Large Hirshfeld Difference N3 -- C44 .. 0.27 Ang.
PLAT234_ALERT_4_B Large Hirshfeld Difference C20 -- C28 .. 0.28 Ang.
PLAT241_ALERT_2_B Check High Ueq as Compared to Neighbors for C12
PLAT241_ALERT_2_B Check High Ueq as Compared to Neighbors for C22
PLAT340_ALERT_3_B Low Bond Precision on C-C Bonds ............... 0.0288 Ang
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor O4 - H4 ... ?
列出的AB错误里没有一个是和PF6相关的。
NPD试着用isor解决
独立O原子，是水吧，需要加氢
最后一个是加氢错误，重新加 : Originally posted by r2rr2r at
列出的AB错误里没有一个是和PF6相关的。
NPD试着用isor解决
独立O原子，是水吧，需要加氢
最后一个是加氢错误，重新加 关键，我一点都不会解晶体啊，都不是很懂，那这样的晶体，能投稿吗 暂时还不能，精修没完成啊。 such errors can be solved by refinement : Originally posted by r2rr2r at
暂时还不能，精修没完成啊。 啊，那给我解晶体的老师还和我说，能投呢，伤不起啊，那这个晶体还能修吗。主要不是投晶体类的文章，只是想说明一下，晶体的结构啊 : Originally posted by superliky at
such errors can be solved by refinement 这个错误还可以精修的吗 应该是能继续修下去的 这样投稿有点难度的吧 还没解完呢，继续努力。解完了很多A类错误都能消除，还有，一些晶体信息补全了，a类错误也就没有了。。B类错误我们一般不管的 : Originally posted by xiaoshan1988 at
还没解完呢，继续努力。解完了很多A类错误都能消除，还有，一些晶体信息补全了，a类错误也就没有了。。B类错误我们一般不管的 哦，因为我打算投合成类的文章，我们老师说对晶体的要求比较低，不知道有没有影响呢，主要这个是求的别的老师解的，我都不好意思求她再解了呢 解的水平不高，要不就是晶体数据不好了。你们老师水中氧上的氢都没加上去啊。。键长键角和温度因子都不是很对，是不是空间群错了&& 查看话题
新手求大神给解决几个A类错误
首先说明一下这个晶体，完整度不够，只有75%左右。解析了一下，仍然还是check了，希望能够得到虫友的解答~~
RFACR01_ALERT_3_A&&The value of the weighted R factor is & 0.45
& && && && &Weighted R factor given& &0.451
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.781 Note&&
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang.
omit 到43，完整度提高到85%左右，再次check后：
THETM01_ALERT_3_A&&The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.550
& && && && &Calculated sin(theta_max)/wavelength =& & 0.5157
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.858 Note&&
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang.
不知道你这个晶体是要干什么？是要发文章么？还是自己看看。如果发文章的话完整度太低了，肯定发不了。
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low 是提示你数据完整度的，低肯定没法解决，只能重新收数据。
RFACR01_ALERT_3_A&&The value of the weighted R factor is & 0.45是提示你wR2值太大，一般精修最好能修到0.15以下。
THETM01_ALERT_3_A&&The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.550这个还是说你数据收集的不够。
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang.这个说你平均键长太长。
最后强烈建议重新收集数据，你这个数据只能自己看。 没有omit之前，
RFACR01_ALERT_3_A&&The value of the weighted R factor is & 0.45
& && && && & Weighted R factor given& &0.451
可能是没有解完，或者晶体质量不好，0.45太高了
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.781 Note
数据收集的时候出的问题， 完成率不够
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang
苯环上的C-C距离太长了，可能存在无序的结构，或者本身晶体质量不好（个人认为这个可能性比较大）
THETM01_ALERT_3_A&&The value of sine(theta_max)/wavelength is less than 0.550
& && && && & Calculated sin(theta_max)/wavelength =& & 0.5157
omit太狠了&&omit&&43 肯定会出这个问题，一般钼靶omit只能到50&&不能为了完成率而一味的omit
个人认为你这数据是达不到发表的水平的，建议重收吧
祝好:hand: : Originally posted by lich666 at
不知道你这个晶体是要干什么？是要发文章么？还是自己看看。如果发文章的话完整度太低了，肯定发不了。
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low 是提示你数据完整度的，低肯定没法解决，只能 ... 谢谢，解答。可是听说是可以修出来的。以您的经验还有没有改进的方法呢？
我omit到50仅出现这两个了：
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.781 Note&&
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang. : Originally posted by 我想更懂你29 at
没有omit之前，
RFACR01_ALERT_3_A&&The value of the weighted R factor is & 0.45
& && && && & Weighted R factor given& &0.451
可能是没有解完，或者晶体质量不好，0.45太高了
PLAT029_ALERT_3_A _dif ... 我也是第一次培养晶体，第一次解晶体。我师兄说这个晶体本来就不好，而且可能还涉及无序的问题（这个您和他说的一样）。
我不是想发文章，只是想解决这个问题，:D
我omit到50
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low .......& && &0.781 Note& &&&（数据收集不好，是不是说老师给测的时候扫数没有最优，可以修正吗？）
PLAT330_ALERT_2_A Large Average Phenyl&&C-C Dist.&&C23& & -C35& && && &&&1.44 Ang.& && & （这个键长的问题，可以修正吗？）
这样的话，您还能给出建议吗？ : Originally posted by fyjcml at
我也是第一次培养晶体，第一次解晶体。我师兄说这个晶体本来就不好，而且可能还涉及无序的问题（这个您和他说的一样）。
我不是想发文章，只是想解决这个问题，:D
我omit到50
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measur ... 数据收的不够，收数据的时候就降低空间群收，比如正交按单斜收，单斜按三斜收，但是这不完全是老师的责任，有的数据就那样，omit之后还不好的话就属于硬伤了
第二个真不好弄，要是无序的话，倒是可以精修一下，只不过无序精修比较麻烦，可是你的R1值0.45，这个不解决你去修无序或者提高完成率就没有什么意义，你要是练手的话，还是找个稍微好点的数据吧 数据发邮箱我看看
: Originally posted by lich666 at
不知道你这个晶体是要干什么？是要发文章么？还是自己看看。如果发文章的话完整度太低了，肯定发不了。
PLAT029_ALERT_3_A _diffrn_measured_fraction_theta_full Low 是提示你数据完整度的，低肯定没法解决，只能 ... 同意。。。 : Originally posted by 我想更懂你29 at
数据收的不够，收数据的时候就降低空间群收，比如正交按单斜收，单斜按三斜收，但是这不完全是老师的责任，有的数据就那样，omit之后还不好的话就属于硬伤了
第二个真不好弄，要是无序的话，倒是可以精修一下，只 ... 谢谢:hand:，下次会注意的:D : Originally posted by wang#zheng at
数据发邮箱我看看
已发:hand:&& 查看话题
求助几个B类错误！！！！
Alert level B
CHEMS01_ALERT_1_B&&The sum formula contains elements in the wrong order.
& && && && &H&&precedes Cu
& && && && &Sequence must be alphabetical for inorganic structures.
PLAT043_ALERT_1_B Calculated and Reported Mol. Weight Differ by ..& && &27.29 Check
PLAT051_ALERT_1_B Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .& && & 7.33 %& &&&
PLAT391_ALERT_3_B Deviating Methyl C2& && &H-C-H Bond Angle ......& && && &99 Degree
Alert level B
CHEMS01_ALERT_1_B&&The sum formula contains elements in the wrong order.
& && && && &H&&precedes Cu
& && && && &Sequence must be alphabetical for inorganic structures.
cif里分子式H应该放在Cu的后面
PLAT043_ALERT_1_B Calculated and Reported Mol. Weight Differ by ..& && &27.29 Check
分子量给错了。
PLAT051_ALERT_1_B Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .& && & 7.33 %&&
分子量给错了。& &
PLAT391_ALERT_3_B Deviating Methyl C2& && &H-C-H Bond Angle ......& && && &99 Degree
C2上加氢不对，删了重新加。 这几个问题都比较容易处理，把数据传上来吧 是啊，没有填好数据吧! : Originally posted by calebby at
这几个问题都比较容易处理，把数据传上来吧 谢谢~谢谢~ 数据已经处理好，见附件。
Bond precision:& & & & C-C = 0.0041 A& & & & Wavelength=0.71073
Cell:& & & & a=7.5293(4)& & & & b=10.5098(7)& & & & c=10.7922(6)
alpha=76.518(5)& & & & beta=81.175(4)& & & & gamma=79.695(5)
Temperature:& & & & 293 K& & & & & & & &
Calculated& & & & Reported
Volume& & & & 811.48(9)& & & & 811.48(8)
Space group& & & & P -1& & & & P-1
Hall group& & & & -P 1& & & & ?
Moiety formula& & & & C36 H32 Cu N6 O4 S2& & & & ?
Sum formula& & & & C36 H32 Cu N6 O4 S2& & & & C36 H32 Cu N6 O4 S2
Mr& & & & 740.35& & & & 740.35
Dx,g cm-3& & & & 1.515& & & & 1.515
Z& & & & 1& & & & 1
Mu (mm-1)& & & & 0.853& & & & 0.853
F000& & & & 383.0& & & & 383.0
F000'& & & & 383.69& & & &
h,k,lmax& & & & 9,12,12& & & & 9,12,12
Nref& & & & 2959& & & & 2951
Tmin,Tmax& & & & 0.829,0.858& & & & 0.835,0.862
Tmin'& & & & 0.829& & & &
Correction method= # Reported T Limits: Tmin=0.835 Tmax=0.862 AbsCorr = MULTI-SCAN& & & &
Data completeness= 0.997& & & & Theta(max)= 25.350
R(reflections)= 0.)& & & & wR2(reflections)= 0.)
S = 1.026& & & & Npar= 272
The following ALERTS were generated. Each ALERT has the format
& && & test-name_ALERT_alert-type_alert-level.
Click on the hyperlinks for more details of the test.
Alert level C
PLAT420_ALERT_2_C D-H Without Acceptor& && &&&N1& &&&-& &H1N& & ..& &&&Please Check
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details&&in the CIF& &&&Please Do ! : Originally posted by calebby at
这几个问题都比较容易处理，把数据传上来吧 可不可以帮我把这几个错误也改一下呢？需要数据的话我上传~
DIFF003_ALERT_1_A&&_diffrn_measurement_device_type is missing
& && && && &Diffractometer make and type. Replaces _diffrn_measurement_type.
SHFSU01_ALERT_2_A&&The absolute value of parameter shift to su ratio & 0.20
& && && && &Absolute value of the parameter shift to su ratio given& &1.384
& && && && &Additional refinement cycles may be required.
PLAT080_ALERT_2_A Maximum Shift/Error ............................& && & 1.38 Why ?
PLAT223_ALERT_4_A Large Solvent/Anion H& & Ueq(max)/Ueq(min) .....& && &&&5.3 Ratio
PLAT415_ALERT_2_A Short Inter D-H..H-X& && & H23A& &..&&H43& &&&..& && & 1.58 Ang.&&
Alert level B
PLAT222_ALERT_3_B Large Non-Solvent&&H& &&&Uiso(max)/Uiso(min) ...& && &&&7.5 Ratio
PLAT420_ALERT_2_B D-H Without Acceptor& && &&&O14& & -& &H14A& &..& &&&Please Check : Originally posted by 蓝色悠云 at
可不可以帮我把这几个错误也改一下呢？需要数据的话我上传~
DIFF003_ALERT_1_A&&_diffrn_measurement_device_type is missing
& && && && &Diffractometer make and type. Replaces _diffrn_measurement_type.
... 发我邮箱&& 查看话题
有一个晶体数据，有A类错误，求高手帮助解决
Alert level A
CHEMW03_ALERT_2_A ALERT: The ratio of given/expected molecular weight as
& && && && &calculated from the _atom_site* data lies outside
& && && && &the range 0.90 && 1.10
& && && &&&From the CIF: _cell_formula_units_Z& && && && && && &&&1
& && && &&&From the CIF: _chemical_formula_weight& && && & 1169.24
& && && &&&TEST: Calculate formula weight from _atom_site_*
& && && &&&atom& &&&mass& & num& &&&sum
& && && &&&C& && &&&12.01& &40.00&&480.44
& && && &&&H& && && &1.01& &48.00& &48.38
& && && &&&Ca& && & 40.08& & 4.00&&160.31
& && && &&&Cl& && & 35.45& & 0.00& & 0.00
& && && &&&N& && &&&14.01& &24.00&&336.17
& && && &&&O& && &&&16.00& &20.00&&319.98
& && && &&&Calculated formula weight& && && && & 1345.28
DENSD01_ALERT_1_A&&The ratio of the submitted crystal density and that
& && && && &calculated from the formula is outside the range 0.90 && 1.10
& && && && &Crystal density given& & =& && &1.660
& && && && &Calculated crystal density =& && &1.443
PLAT043_ALERT_1_A Calculated and Reported Mol. Weight Differ by ..& && &44.02 Check
PLAT046_ALERT_1_A Reported Z, MW and D(calc) are Inconsistent ....& && &1.443& && &
PLAT051_ALERT_1_A Mu(calc) and Mu(CIF) Ratio Differs from 1.0 by .& && &10.59 %& &&&
PLAT305_ALERT_2_A Isolated Hydrogen Atom (Outside Bond Range ??)& && && & H1E Check
你按照lst文件把ins文件中原子个数改过来，然后按照check的结果把Z值改过来，最后检查一下H1E这个原子，它是孤立的，没有母原子，看看在你的结构中存不存在，可以适当的限制一下在精修 jia&&qq: 应该是Z值不对，修改一下就好了 你可以联系QQ
给你处理 : Originally posted by wang#zheng at
你可以联系QQ
给你处理 希望您能给处理一下，谢谢}