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我用rms包的lrm()函数做logistic回归,使用代码及结果如下:fitmodel&-lrm(y~A1+A2+A3,data=train,x=T,y=T)复制代码得到fitmodel如下:
21:53:37 上传
然后进行summary,得到结果如下:
21:53:44 上传
从中可以轻松得到各因子的系数,但OR值该怎样计算呢,OR值是不是在第二张图中effect的那一列呢?如果是,那应该取哪一行呢?
有人说OR值应该是e的系数次方,但这样做因为有个系数很大,OR值会变得很大,个人觉得不合理,而且系数最大的那一个因子单独做预测时效果是最差的,OR值最大也不合理。
希望有高手给予指导解答,不胜感激!
为什么不直接用glm?
本帖最后由 newcafans 于
21:37 编辑 foozhencheng 发表于
为什么不直接用glm?啊,大神又是你啊
用lrm是因为我们组的人之前一直用的原因吧。
试了下glm,貌似算不了OR值的置信区间啊,而且不能画nomogram
newcafans 发表于
啊,大神又是你啊
用lrm是因为我们组的人之前一直用的原因吧。有道理, 不过根据回归的结果可以计算log-odds的置信区间,再转换过去就可以了。nomogram是什么?
newcafans 发表于
啊,大神又是你啊
用lrm是因为我们组的人之前一直用的原因吧。请问rms包里面的lrm适合什么情况,有没有例子呢
foozhencheng 发表于
有道理, 不过根据回归的结果可以计算log-odds的置信区间,再转换过去就可以了。nomogram是什么?nomogram不是列线图吗?
不过我们老板后来说不画nomogram了,我也就没管了,也没上来论坛看了
同一个数据,我分别用这两个函数:lrm()和glm()试了一下,拟合logistic 回归模型,自变量的系数好像不太一样啊,但是p值差不多。是否意味着随便用哪个函数都可以呢?
rms包的lrm( )函数做完logistic回归后,用options(prType='plain'),print(fitlrm, coefs=4)显示自变量的系数,然后用exp( )求出OR值。用summary( )好像不对
wanglao 发表于
rms包的lrm( )函数做完logistic回归后,用options(prType='plain'),print(fitlrm, coefs=4)显示自变量的系 ...请问能否具体讲一下option和print要写在哪里吗 试了一下加在后面不行啊
sunflower_sara 发表于
请问能否具体讲一下option和print要写在哪里吗 试了一下加在后面不行啊写在拟合模型表达式的后面。显示的类型在options()里面修改,下面是显示为latex格式的。例如
f &- lrm(ch ~ age)
options(prType='latex')
print(f, coefs=4)&&# write latex code to console
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