mega计算碱基的属于转换的碱基替换是/颠换,插入和缺失中的si、sv、r分别表示什么

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3秒自动关闭窗口Jukes-Cantor模型和Kimura的双参数模型的对称性说明四...如果不区分转换和颠换(也就是说p = P + Q),...但同义 替换率的差别很少超过两倍,而异义替换率却有......https://www.haoxp123.com/p1db.htmlA.转换B.颠换C.移码突变D.DNA大段损伤E.裂隙
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一级...https://www.haoxp123.com/p11bcaf3ebcf84b9d528ea81c72f45.htmlMega6中文使用说明_生物学_自然科学_专业资料。MEGA6的中文使用说明陈晨 2014.4...3. 考虑到了不同碱基替换的不同的比率,考虑 到了碱基转换和颠换的差别。 ? ......https://www.haoxp123.com/p1ec5c881f6aeb.html包括转换、颠换、缺失和插入,形成的遗传标记,其数 ...一般而言,SNP 是指变异频率大于 1 %的单核苷酸 ...具有高的连锁不平衡的区域中具有代表 性的单核苷酸......https://www.haoxp123.com/p1cee16af61ed9ad51f11df26d.html实际上,通常转换比颠换出现更频繁。因此, P将大于Q/2。当序列间的分歧度低时...图中,不同的氨基酸分 别用不同的单字母代表。图5-1 六种脊椎动物血红蛋白α......https://www.haoxp123.com/p1a8d56ae2360cba1aa811dade.html
[解析] 转换和颠换都属于点突变,是引起碱基错配而致读码错误,使翻译的氨基酸改变...https://www.haoxp123.com/pb2f60ddccda38e69c.html单选题
可引起读码框移的突变是 A.转换B.颠换C.点突变D.缺失终止密码子E...https://www.haoxp123.com/p1bff111fb.htmlphylip使用说明_生物学_自然科学_专业资料。本文简单介绍phylip的功能,并附有最...iii 没有过多的颠换/转换的倾向, iv 所检验的序列的碱基数目较多(大于几千个......https://www.haoxp123.com/p1ffcd0496459fb.html转换-颠换矩阵、blast 矩阵;蛋白质打分矩阵:等价矩阵...PAM矩阵的制作步骤:①构建序列相似(大于85%)的比对...P(+|N)代表不吸毒者阳性检出率,也就是出错检测的......https://www.haoxp123.com/p13adce97a30126edb6f1aff00bed5b9f3f80f724d.html实际上,通常转换比颠换出现更频繁。因此, P将大于Q/2。当序列间的分歧度低时...图中,不同的氨基酸 分别用不同的单字母代表。 表 5-5 不同脊椎动物血红蛋白......https://www.haoxp123.com/p1fb5ea5802ff11.html( K;=&’ !" #$ 2 ,$##")计算不同 序列 间转换 + 颠换数; 采用 @...基因序列差异超过 ’$& , 认为它们属于不同的姐妹种( ! / -(*$).*(*&......https://www.haoxp123.com/p1abbaca2009184.html
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求高手帮忙解释下MEGA计算核酸转换/颠换比率的结果
应用MAGA5.0软件,计算转换/颠换比率,对计算出来的结果疑惑,请大家帮忙解释下,万分感谢!
1、si=0.00,怎么有R=0.36?另外“转换位点数+颠换位点数”应该等于变异位点数吧,?
2、ii = 935.00是怎么计算出来的,平均值?
3、TT、TA、TG、Domain Info等都表示什么意思?
软件计算结果如下:
All frequencies are averages (rounded) over all taxa.
ii = Identical Pairs
si = Transitionsal Pairs
sv = Transversional Pairs
Domain& & & & & & & & ii& & & & si& & & & sv& & & & R& & & & TT& & & & TC& & & & TA& & & & TG& & & & CT& & & & CC& & & & CA& & & & CG& & & & AT& & & & AC& & & & AA& & & & AG& & & & GT& & & & GC& & & & GA& & & & GG& & & & Total& & & & Domain Info
1& & & & Avg& & & & 935.00& & & & 0.00& & & & 1.00& & & & 0.36& & & & 345.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 168.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 278.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 0.00& & & & 144.00& & & & 935.77& & & & Data
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MEGA5怎么求序列颠换和转换数已有2人参与
在mega软件中,序列的颠换与转换数、颠换/转换值怎么求?非常感谢!
论文表格中常出现的si=transitional pairs, sv=tranversational pairs, ii=identical pairs
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【答案】应助回帖
在mege 中, statistics- Nucleotide-Pair Frequencies 可以计算出来,你试一下。
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